В 1722 году вместо часовни при партикулярной верфи на фонтанке был построен деревянный храм. Приказ об освещении храма воимя святого великомученика и целителя Пантелеймона прислал личный Пётр первый. Эту церковь император задумал как храм – памятник русскому флоту, знак благодарности за две морские победы при Гангуте и при Гренгаме – обе были одержаны в день святого Пантелеймона. В 1734 году рядом был заложен новый каменный храм, который был построен по проекту Н. Шумахера к 1739 г.. Пантелеймоновская церковь – одна из немногих сохранившихся построек в стиле Аннинского барокко.